在
高新认定
管理工作中出现的难题大体可以阐述如下：
1.不理解、不确切开放政策。不少企业没有关注新高新认定国际标准，对于新国际标准不太了解，在准备的资讯的步骤中，依然按照去年的想法进行，结果的资讯不完备，从而导致无法通过认定。
2.不重视本次认定。部份企业雇员受了一些培训机构的讲解后，认为的资讯准备比较非常简单，没有该系统的安排新的认定的准备管理工作、投入足够的劳力，结果认定准备恐慌，的资讯无法体现企业材高新专业知识，最后也无法通过认定。
3.企业外部管理工作不能够协调。高新认定管理工作涉及财政、技术、劳力等诸多机构，由于事先未能统合理解高新认定的标准，导致机构配合不协调，的资讯准备不完全一致，拖延了审批的步骤、甚至无法完成本年度的审批。
二、自身专业知识难题
在明确高新认定前提准备中，我们发现企业自身专业知识难题点主要集中在下述几个各个方面：
(一)一般性基准不达标
1.高新各个领域无法定义。
由于此次高新各个领域的变更，原有的部份各个领域被删除或简化，同时新各个领域在某些部份存在模棱两可，比如第五大类的“高新技术零售业”，明确规定颇为习惯上。因此不少企业无法找到几乎贴合企业的产品或技术的各个领域，从而导致企业在审批时出现各个领域选择不精确而无法通过评判的状况。
2.架构自主著作权缺乏。
由于中国专利保护幅度依然在完善中，当企业拥有了企业反超的技术后，一般不太愿意进行公开发表专利。这就导致很多企业虽然具有符合高新各个领域的技术或的产品，其相应的怎么注册香港公司技术等也的确达到国外甚至国际性领先地位，但囿于专利的限制，仍然无法达到高新认定的要求。
3.工程项目归集艰难。
在本次标准下，很多企业进行工程项目归集时不能不错的描绘符合高新各个领域的元素，导致研发工程项目不被评判研究员所认可，从而使得该工程项目相关的费用等被扣除出研发费用，进而让企业出现研发费用达不到比率的境遇。
(二)财政性基准严重不足
1.研发费用严重不足
对于研发费用归集，税务【2006】88号文，财企【2007】194号文均有相关明确规定，而本次管理工作指引最后设定的研发费用审计范围内与会计准则非常完全一致，企业进行费用归集的时候存在阻碍，甚至不少进行专项审计的中介机构在后期也无法具体研发费用的归集，这在相当大高度上拖延了企业材高新审批程序在。在此，对研发费用的八个审计范围内详列如下，以参考文献：
(1)工作人员人工。从事研究开发娱乐活动工作人员(也称研发工作人员)年均薪水薪酬，包括薪资、奖品、退休金、怎么注册香港公司支出、年内薪酬、加班薪水以及与其任职或者受雇有关的其他支出。医疗保险不被纳入此项投入。
(2)必要投入。企业为实施研究开发工程项目而购买的原料等相关支出。如：水和燃油(包括石油气和电)费等;用于两边测试和的产品试制达不到人民币国际标准的铸件、样本、原型机及一般试验方式购置费、试制的产品的检验费等;用于研究开发娱乐活动的教学设备的非常简单维护费;以经营管理租赁方法租入的人民币发生的租赁费等。
(3)折旧费用与长年待摊费用。包括为执行研究开发娱乐活动而购置的测量仪器和电子设备怎么注册香港公司以及研究开发工程项目在用建筑的折旧费用，包括研发公共设施改建、改装、装修和修理步骤中怎么注册香港公司发生的长年待摊费用。
(4)的设计费用。为产品和新工艺的构思、开发和制造，进行成品、规范、操作优点各个方面的的设计等发生的费用。
(5) 武器装备试运行费。主要包括工装准备步骤中研究开发娱乐活动所发生的费用(如研发制造机器人、铸件和机器，改变制造和总质量控制程序，或制定新技术及国际标准等)。为大规模大批量化和商业性制造所进行的常规性工装准备和制造业工程建设发生的费用不能计入。
(6)资产摊销。因研究开发娱乐活动需要购入怎么注册香港公司的专有技术(包括专利权、非专利发明、许可、专有技术、的设计和计算方法等)所发生的费用摊销。
(7)交由内部研究开发费用。是指企业交由全境其他企业、的大学、研究政府机构、转制医疗机构、技术专业知识公共服务政府机构和国外政府机构进行研究开发娱乐活动所发生的费用(工程项目研究成果为企业拥有，且与企业材主要经营管理的业务密切相关)。交由内部研究开发费用的发生额度应按照独立买卖准则确定。认定步骤中，按照交由内部研究开发费用发生额的80%计入研发费用总值。
(8) 其他费用。如办公费、通讯费、专利维护费、高新科技研发保费等。此项费用一般不得超过研究开发总费用的10%，另有明确规定的除外。
2.高新收入达不到国际标准
企业高新产榀的收入一般更容易审计。但一些从事经济开发区公共服务的企业则存在难题，由于原有管理工作的缺失，许多企业材技术服务收入未在技术消费市场进行登记，或登记的合约实际收入未满收入的60%。对于这一状况，在2008本年度的认定管理工作中，各地政府机构把握的时间尺度非常统合。以怎么注册香港公司上海为例，科委要求该类企业在高新审批时必需提供登记合约，而其他很多大多则并没有如此要求。但可以预见的是，在2009年随着高新认定管理工作的更进一步完善，技术服务收入的合约必需登记将成为高新审批的必备条件。
(三)其他基准存在难题
在本次认定步骤中，有不少企业组织管理水平欠缺。少有的就是许多原先就具有高新名额的企业并没有比较完善的研发组织和管理模式，较少的采取的是粗放式管理工作，在准备相关的资讯的时候未能较差的进行提炼整合，使得企业在此各个方面不能够不错的得分。
此外，在高科技与研发工作人员管理工作上，也有企业比较不完善，尤其是一些科研机构转制的企业，院企无分，导致高科技与研发工作人员无法确定总人数。
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